近日,我中心何帅兵同学在Bioinformatics杂志上发表了题为 “Site of metabolism prediction for oxidation reactions mediated by oxidoreductases based on chemical bond”的文章。在此文章中,作者首次从化学键的角度出发,融合化学键数据与代谢酶信息,通过机器学习的方法成功构建了药物体内代谢产物预测模型。该项研究为中药化学成分代谢产物的预测提供了更准确的方法,对药物发现和完善中药作用机理辅助解析系统具有重要意义。Bioinformatics杂志为生物信息学研究领域的顶级杂志,该杂志2015年的影响因子为5.766,主要刊登基因组生物信息学和计算生物学方向具有前瞻性发现的文章。
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http://bioinformatics.oxfordjournals.org/cgi/reprint/btw617?ijkey=zqX2r92EiDx5BVY&keytype=ref
Figure: The identification procedure of negative SOMs of an example chemical. 1, 0, and -1 (in the small box) represent positive SOM, unlabeled SOM,
and negative SOM respectively.